Uz tiskana djela i pisma, Zbirka rukopisa i starih knjiga Nacionalne i sveučilišne knjižnice u Zagrebu čuva i Boškovićev rukopis-autograf Versi fatti in settembre 1777 otkupljen godine 1952. iz ostavštine Mirka Breyera te rukopis Virgo sine labe concepta, stihove na latinskom i talijanskom jeziku prepisane krajem 18. st.

Rukopis-autograf Versi fatti in settembre 1777 dostupan je u okviru Digitalne zbirke djela Ruđera Boškovića.

U Zbirci su također pohranjeni rukopisi te tiskana djela Ruđerove sestre Anice i braće Bartola i Petra.